Archive des articles :: scientist-publications

Visionneuse d'alignements multiples

01/09/2014 01:01

SEAVIEW Cette plateforme a une interface graphique permettant de visualiser des alignements multiples de séquences d'ADN, d'ARN et de protéines et des arbres phylogénétiques sous différents formats (nexus, msf, clustal, fasta, phylip...). Vous pouvez lancer des analyses phylogénétiques directement...

Utilitaires divers

31/08/2014 23:47

PDF Converter Cet outil convertit vos fichier pdf en fichier powerpoint (format pptx uniquement) Compress PDF Cet outil diminue la taille de vos fichier pdf en diminuant la résolution à 144dpi.

PUJOL Vincent

26/08/2014 13:54

Identification of a stem rust resistance locus effective against Ug99 on wheat chromosome 7AL using a RAD-Seq approach Development of a SNP marker assay for the Lr67 gene of wheat using a genotyping by sequencing approach

[Thèse] Haplotyping in polyploid crops using genetics, genomics and bioinformatics

25/08/2014 10:30

Durée du poste: 4 ans Date de début: Sa, 01/11/2014 Wageningen University, plant breeding Date limite de candidature: Lu, 15/09/2014 Nom du contact: Dr. Chris...

Design d'amorces

22/08/2014 23:02

Primer3, GenScript Primer Design, GenScript Sequencing Primer Design et TaqMan Primer Design Ces programmes permettent de dessiner des oligos d'une séquence d'ADN pour réaliser des PCR, qPCR et des séquençages. Primer-Blast Ce programmes permet de dessiner des oligos d'une séquence d'ADN et...

Prédictions de sites et de régions protéiques

21/08/2014 12:53

2ZIP C'est un prédicteur de domaines Leucine Zipper. 3of5 C'est un logiciel qui trouve des motifs définis par l'utilisateur dans les séquences protéiques. APSSP et Jpred Ce sont des prédicteurs de structures secondaires des protéines à partir des séquences en acides...

Identification et annotation d'éléments répétés

20/08/2014 14:35

Internal Repeat Finder Détection de répétions de novo par allignement de la séquence contre elle-même. LTR Finder Ce programme détecte les retrotransposons LTR de pleine longueur dans les séquences du génome RepeatExplorer C'est un ensemble d'outil pour l'identification d'élements...

Annotations structurales et fonctionnelles

20/08/2014 14:17

Artemis C'est un navigateur de génome et d'annotation structurale et fonctionnelle permettant de visualiser les caractéristiques des séquences et les résultats des analyses dans le contexte des séquences et aussi dans le contexte de sa traduction dans les 6 cadres de lectures. Je conseille cet...

Recherche d'ARN non codants

20/08/2014 14:09

tRNAscan-SE C'est un prédicteur d'ARN de transfert (ARNt) dans les séquences génomiques. RNAmmer C'est un prédicteur dARN ribosomiques (ARNr) dans les séquences génomiques. Snoscan C'est un prédicteur de petits ARN nucléolaires (snoRNA) de type C/D dans les séquences...

Outils bioinfo

20/08/2014 14:00

Ajout d'une section qui référence des outils pour réaliser des analyses bioinformatiques