[CDD IE]Analyse et visualisation des données issues de séquençage à haut débit

L’ingénieur d’étude aura pour mission la mise en œuvre des différents 
outils nécessaire au stockage, au traitement, à l’analyse et à la 
visualisation des données issues de séquençage à haut débit dans le 
cadre de l’étude moléculaire de la diversité du vivant et la 
reconstruction de génomes d’organelles. Il/elle aura également pour 
mission de conseiller et former le personnel du laboratoire d’accueil et 
des membres du labex CEBA aux outils bioinformatiques disponibles.



Activités principales :


Analyser des données issues de séquençage haut débit (séquençage massif 
d’amplicons issus d’ADN environnemental, séquençage de génomes en shotgun)

Assurer le stockage et la gestion des données en lien avec le service 
informatique du laboratoire

Gérer et maintenir des bases de référence locales de séquences

Former les biologistes aux outils bioinformatiques

Assurer la veille scientifique et technique

Assister dans le choix et la réalisation d’analyses de données de 
séquençage adaptées



Compétences requises :


Diplôme d’Ingénieur ou Master en bioinformatique

Maîtrise de l’environnement Linux

Connaissances en programmation (C++, python, PHP, R …)

Expérience significative dans l’analyse de données issues des 
technologies de séquençage à très haut débit

Notions solides de statistique

Maîtrise de l’anglais scientifique et technique

Capacité à interagir avec des personnes ayant des thématiques diverses 
(Recherche : biologie évolutive, écologie ; Informatique)

Expérience de bioinformatique dans un laboratoire de biologie souhaitée

Sens de l’organisation, méthode et rigueur

Autonomie et bonne capacité de communication et d’adaptation



Nature d’emploi : CDD CNRS à temps complet 12 mois renouvelable, poste à 
pourvoir le 1er octobre 2014.


Niveau de qualification: bac+5 (niveau Master).


Rémunération : d’après les grilles de salaire du CNRS, selon profil et 
expérience.


Contacts :

Pour tout question complémentaire : Jérôme Chave, jerome.chave 
<arobase>univ-tlse3.fr


Modalités de candidature : envoyer un email contenant CV et lettre de 
motivation avec en-tête « Poste IE bioinformatique EDB-CEBA ». Cet email 
doit comporter uniquement deux fichiers PDF en courrier attaché et avec 
les noms suivants : NOM_Prenom_CV_IEbioinfoEDB.pdf et 
NOM_Prenom_motivation_IEbioinfoEDB.pdf

Envoi des candidatures à amaya.pelozuelo<arobase>univ-tlse3.fr

Date limite de candidature le 10 juillet 2014 inclus ou tant que le 
poste reste vacant