Archive des articles :: scientist-publications

The Plant Pathogen Xanthomonas campestris pv. campestris Exploits N-Acetylglucosamine during Infection

09/09/2014 00:00

Alice Boulanger, Claudine Zischek, Martine Lautier Stevie Jamet, Pauline Rival, Sébastien Carrère, Matthieu Arlat and Emmanuelle Lauber Résumé: N-Acetylglucosamine (GlcNAc), the main component of chitin and a major constituent of bacterial peptidoglycan, is present only in trace amounts in...

Isolation and molecular characterization of ERF1, an ethylene response factor gene from durum wheat (Triticum turgidum L. subsp. durum), potentially involved in salt-stress responses

09/09/2014 00:00

Emna Makhloufi, Fatma-Ezzahra Yousfi, William Marande, Isabelle Mila, Mohsen Hanana, Hélène Bergès, Rim Mzid and Mondher Bouzayen Résumé: As food crop, wheat is of prime importance for human society. Nevertheless, our understanding of the genetic and molecular mechanisms controlling wheat...

Analyses de données de génétique

02/09/2014 15:50

LD software list Une liste de logiciels pour l'analyse du déséquilibre de liaison. Genetic analysis software list et list2 Listes de logiciels pour l'analyse de données de génétique.

[IR] Métagénomique / Métatranscriptomique Projet TARA Océans

02/09/2014 10:20

18 mois Evry CEA / Genoscope Adresse: 2 rue Gaston Crémieux 91000 Evry Nom du contact: Eric Pelletier Email du contact: eric.pelletier@genoscope.cns.fr TARA Océans est un projet...

[Postdoc] Exploration des génomes de champignons symbiotiques forestiers et analyses fonctionnelles de données métatranscriptomiques

02/09/2014 10:18

15 mois à Champenoux INRA UMR 1136, Interactions Arbres/Microorganismes (IaM) INRA Nancy-Lorraine route d'Amance 54280 Champenoux Emmanuelle Morin Marc Buée Annegret Kohler Francis Martin Email du...

Statistiques descriptives de séquences protéiques

01/09/2014 01:13

Compute pI/MW Cet outil calcul le point isoélectrique théorique et le poids moléculaire des protéines GlycanMass C'est un calculateur de masse d'un oligosaccharide. GPMAW lite C'est un calculateur de paramètres chimiques et physiques des protéines. Isotopident C'est un...

Diagramme de Venn

01/09/2014 01:10

Drawn Venn Diagram C'est une autre application web qui génère à partir de listes d'éléments (au maximum, 30 listes), une sortie textuelle en indiquant les éléments présents dans plusieurs listes ou uniques à une liste et pouvant aussi générer un diagramme de Venn si le nombre de listes est...

Création de logos

01/09/2014 01:09

WebLogo et GENIO/logo Ce sont des applications web qui génèrent un logo de séquences à partir d'un alignement multiple. PLOGO C'est un outil pour créer des logos de protéines en utilisant l'entropie relative. Wordle C'est une application web qui génère un "nuage de mots" à partir d'un...

Edition d'arbres phylogénétiques

01/09/2014 01:09

FigTree, Dendroscope, Archaeopteryx, TreeDyn et TreeView Ce sont des programmes permettant de visualiser, de manipuler, de modifier, d'annoter et de colorier des arbres phylogénétiques.

Alignements pairés de séquences

01/09/2014 01:03

exonerate Cet outil permet de réaliser des alignements de séquences idéalement des séquences de courtes tailles (ESTs, lectures NGS, protéines) sur des séquences de grandes tailles (génomes, transcriptomes). GeneWise Ce programme aligne des séquences protéiques sur des séquences ADN ou...